Das Centrum Modernes Griechenland versteht sich als Knotenpunkt für die Vernetzung der deutsch-griechischen Forschung. Die Anbahnung internationaler Forschungsprojekte und Kooperationen mit deutschen und griechischen Forschungseinrichtungen nimmt in diesem Zusammenhang eine zentrale Stellung ein. Im Sinne dieses Anliegens fungiert das CeMoG u.a. als Gastinstitution für Forschungsprojekte, die sich mit der Geschichte der deutsch-griechischen Verflechtungen befassen. Einige dieser Projekte werden im Folgenden aufgeführt.